Grał w II lidze przez 11 lat, od 1992/93 w jednej z dwu grup, następnie od 1999/2000 w jednej grupie (osobne hasło: Hetman w piłkarskich rozgrywkach ligowych 1956-2010). W rankingu krajowym najwyżej notowane było miejsce VII z 2001/2002, uwzględniając I ligę, 23 miejsce w Polsce, przy obecnym układzie rozgrywek, byłby to środek tabeli pierwszoligowej!

92/93 93/94  94/95 95/96 96/97 97/98 98/99 99/00 00/01 01/02 02/03
XI IX VIII XIV XIV XIII VII XVI XIV VII XVII

Jesienią 1994 po 7 kolejkach "Hetman" znalazł się na pierwszym miejscu II-ligowej tabeli, na pierwsze miejsce awansował też w VIII 1998 po 3 kolejce rozgrywek!
Pierwszy historyczny mecz odbył się 9 VIII 1992 w Zamościu (Motor L. 1:1), ostatni mecz przed własną widownią rozegrał 4 VI 2003 (Górnik Ł. 0:1). Najwyższe miejsce po rundzie jesiennej w 1994/95 - IV miejsce (tylko 3 pkt straty do drugiego, premiowanego awansem miejsca, za Siarką. Bełchatowem i Piasecznem),
Wygrał 111 meczów, 117 zremisował, 126 przegrał, stosunek bramek 405:432.
Najczęściej wychodzili na boisko: Pliżga 297, Pidek 204, Turkowski 200, Szala 165, Płoszaj 155, Bożyk 143, Łukiewicz 131, Zagrodniczek 123, Cios 122, Zajączkowski 119, Gamla 110, Ziarkowski 106.
Najwięcej goli zdobyli: Pidek 50, Ziarkowski 44, Pliżga 35, Płoszaj 20, Bielak 19, Sajdak 15, Szajkowski 14, A. Rycak 13, Cios 12, Jurkowski 10.
Trenerzy - najwięcej meczów: Jerzy Krawczyk 73, Wiesław Wieczerzak 69, Zbigniew Bartnik 40, Włodzimierz Gąsior 37, Bronisław Waligóra 34.
W czasie, gdy grał w II lidze, "Hetman" odnosił zwycięstwa nad najbardziej utytułowanymi klubami w Polsce, z byłymi mistrzami Polski:
Wisła Kraków 1:0 (1996 pp), ponadto 2:2 (1995),
ŁKS 1:0 (1997), 1:0 (2000), ponadto 0:0 (2001),
Lech Poznań 3:0 (2001) i 0:0 na wyjeździe (2000),
Śląsk Wrocław 2:0 (2002), ponadto 0:0 (1999),
Polonia Bytom 1:0 na wyjeździe (2001), ponadto 1:1 (2000),
Cracovia 3:1 (1998),
Szombierki Bytom 2:0 (1993), 3:0 i 2:1 (1994),
Stal Mielec 1:0 (1993) i 2:1 (1997),
z wicemistrzami Polski:
Zagłębie Sosnowiec 1:0 (2000), 2:0 (2001),
Pogoń Szczecin 2:1 (2000 pl),
GKS Bełchatów 1:0 (1994), 4:1 (1998 z Krzynówkiem na czele), 4:2 i 4:1 (2002)
a także zremisował z
Legia Warszawa 0:0 (1994 pp, był to sezon, w którym Legia została mistrzem kraju),
GKS Katowice 1:1 na wyjeździe (1999 pp), 1:1 na wyjeździe (1999) i 1:1 (2000),
wygrywał też z
Lechią Gdańsk 1:0 na wyjeździe (1999), 3:2 i 5:1 (2000), 2:1 na wyjeździe i 3:0 (2001),
Jagiellonia Białystok 1:0 (1995), 2:1 (2001),
Odrą Opole 4:1 (2001),
Stomil Olsztyn na wyjazdach 2:1 (1994) i 5:1 (2000)
Wygrywał z drużynami trenerów: Grzegorza Laty (Stal M.), Henryka Apostela (Wisła K.), Wojciecha Łazarka (Śląsk W., Jagiellonia B.), Adama Nawałki (Sandecja NS) - selekcjonerów drużyny narodowej.
Na zamojskim boisku grali wówczas m.in. Żewłakow (1996, br.), Krzynówek (1998), Majdan (2000), Mila (2000), Niedzielan (2000).
 * W tabeli wszechczasów I ligi 1949-2012 (przed sezonem 2012/2013) czyli drugiej w hierarchii klasie rozgrywkowej wśród 188 zespołów "Hetman" znajdował się na 50 miejscu - 11 sezonów, 388 meczów, 478 pkt, 437-492 bramek, zwyc. 119, remisów 121, przegranych 148.
Bezpośrednio przed nim Stal Szczecin (13 sezonów), Wawel Kraków (14), Moto Jelcz Oława (13), a za Miedź Legnica (10), Lech Poznań (10) i Star Starachowice (13). Tabeli przewodzi Piast Gliwice (35 sezonów), Lechia Gdańsk (32), Zawisza Bydgoszcz (32). W tabeli Motor - 11, Avia - 21, Górnik Ł. - 32, Lublinianka - 80.


 * Do historycznego awansu doszło 27 VI 1992 z zakończeniem meczu z Bucovią Bukowa (5:0) ok. 18.45 w obecności ok. 4 tys. widzów i m.in. Michała Listkiewicza (wiceprezes PZPN).
 * W historycznym sezonie "Hetman" zapewnił sobie awans pokonując 13 VI 1992 - Wisłę Puławy 8:1 (mecz oglądał Kazimierz Górski), rewanżując się za porażkę sprzed dwóch lat 1:8.
 * W II lidze początkowo premie za zwycięstwo wynosiły 2 mln st. zł (śr. pensja wówczas 3 mln) na głowę, za następne kwota rosła o milion. W sezonie 1993/94 dochody z biletów wyniosły 2,5 mld st. zł.
 * Anegdota: za awans mieli dostać po polonezie caro, a piłkarze, że zamiast tego wódkę Polonez i papierosy Caro.
 * O II ligę walczyła w 1950 "Sparta", osiągając następujące wyniki: z "Włókniarzem" Częstochowa 0:5 i 2:1, "Unią" Pionki 1:3 i 0:2, "Concordią" 2:4 i 0:4, zajmując ostatnie czwarte miejsce. W 1953 o awans do II ligi grał KS Zamość przegrywając z OWKS Lublin (3:1 i 0:6).