Pierwsze organy o 2 klawiaturach, 26 głosach z prześliczną strukturą i 6 miechach sprawiła Kolegiacie w 1696 Anna z Gnińskich Zamoyska. Zamilkły w 1830, zastępował je 6-głosowy pozytyw. Obecne 25-głosowe ufundował kosztem 5,5 tys. rubli Maurycy Zamoyski. Wykonał je i zainstalował 6 IX 1895 Jan Śliwiński ze Lwowa. 9-metrowej wysokości prospekt zdobi eklektyczna dekoracja z pozostałą po starych organach figurą muzykującego na harfie króla Dawida (wg lustracji bijącego w lutnią, nie zachowały się anioły z trąbami). Współcześnie konserwowane w 2007-2009.