Pierwszymi osiadłymi tu zakonnicami były klaryski, siostry miłosierdzia. W 1642 wzmiankowana była Anna Dymidecka zakonnica Greckiej Religii Konwentu Lwowskiego.  Na przeciw kościoła franciszkanów znajdował się  znany z obrazu bukowińskiego obiekt zwieńczony krzyżem, identyfikowany jako kościółek (kaplica) kapucynek. W 1772 było w Zamościu ok. 10 klarysek.
W powstałym w Zamościu szpitalu do I wojny pełniły służbę Elżbietanki (w 1901 określone jako siostry miłosierdzia kościoła wschodniego). W 1924 przy ul. Żdanowskiej osiadły Franciszkanki Misjonarki Maryi. W 1931 doszło do powstania samozwańczego zgromadzenia Marii Przybysławskiej, które założyła przy ul. Listopadowej - rozwiązane w 1939 (pozyskała grunt, zbudowała dom, utrzymywała się ze zbiórek i "wian" skierowanych do niej przez rodziców dziewcząt. nawet do 6-ciu). 
Od 1940 w Zamościu pracowały s.s. Józefitki.  W 1950 zastąpiło je Zgromadzenie Sióstr Najświętszego Imienia Jezus (ul. Kolegiacka 1, Peowiaków 1) - ob. przełożona domu s. Helena Lato (1999 - 8 przy Katedrze, 33 przy domu diecezjalnym). W grobowcu na cmentarzu spoczywa 5 sióstr  (zm. mędzy 1983 i 2017).
Działa też Żeński Instytut Życia Konsekrowanego Spigolatrici della Chiesa (1999 - 5 osób, ul. Peowiaków 70).


 * W XVII w. dom przy ul. Grodzkiej posiadały ...Dominikanki z Bełżec (sprzedały w 1667 za 1800 zł).